Mappa genetica offre speranza per cervo maculato di Visayas in pericolo: scopri i dettagli!
Gli scienziati hanno sequenziato il primo abbozzo del genoma mai realizzato del Visayan spotted deer, una specie altamente minacciata delle Filippine. Il genoma potrebbe guidare gli sforzi per salvarlo dall’estinzione, come riporta il collaboratore Pippo Carmona per Mongabay.
Il Visayan spotted deer (Rusa alfredi) un tempo si trovava su sei isole nelle Filippine centrali. Ma la deforestazione e la caccia hanno decimato la sua popolazione, portando l’IUCN, l’autorità globale per la conservazione della fauna selvatica, a classificarla come specie in pericolo nel 1988. Nel 2019, le autorità filippine avevano classificato la specie come nazionalmente criticamente minacciata. L’ultimo censimento del 2016 ha registrato solo circa 700 individui maturi, ora presenti solo sulle isole di Negros e Panay.
Per comprendere la salute genetica della specie, i ricercatori dell’Università di Silliman e del Philippine Genome Center Visayas hanno collaborato per mappare il suo DNA.
Hanno utilizzato un campione di tessuto prelevato da Abraham, un Visayan spotted deer allevato e morto presso il Centro per gli Studi sulla Conservazione Tropicale (CENTROP) dell’Università di Silliman. Il genoma sequenziato contiene 2,5 miliardi di lettere del DNA e 24.531 geni. È il primo genoma sequenziato per uno degli animali in via di estinzione delle Filippine.
I ricercatori hanno scoperto che il punteggio di eterozigosi di Abraham, misura delle differenze genetiche, era solo dello 0,17, molto al di sotto dello 0,3 tipico delle popolazioni selvatiche sane e geneticamente diverse. Il basso punteggio indica che i genitori di Abraham erano geneticamente strettamente imparentati.
“Poiché Abraham proviene da una popolazione in cattività, ci aspettavamo di ottenere un risultato di eterozigosi basso”, ha detto Albert Noblezada, responsabile del programma di bioinformatica presso il Philippine Genome Center Visayas. Noblezada ha aggiunto che decenni di isolamento hanno permesso all’incesto di radicarsi silenziosamente nella colonia in cattività.
Nonostante ciò, il biologo Persie Mark Sienes dell’Università di Silliman ha dichiarato di voler vedere quanto diversità genetica rimanesse nella popolazione e se ci fossero individui che portassero variazioni genetiche in grado di migliorare gli esiti della riproduzione. Così ha esaminato il genoma e identificato un marcatore genetico che potrebbe aiutare a ripristinare la salute genetica della colonia. “Abbiamo identificato un allele raro trovato solo in un individuo qui, e fortunatamente questo individuo è ancora sessualmente attivo”, ha detto.
Il biologo dell’Università di Silliman, Robert Guino-o, ha dichiarato che questa scoperta è la prova che serviva per rinnovare la riproduzione in cattività di CENTROP. “Stiamo perseguendo un protocollo di riproduzione basato sul genoma,” ha detto Guino-o, aggiungendo che questo sostituirà il vecchio metodo basato interamente sulla tracciatura del pedigree.
I ricercatori concordano sul fatto che per aumentare la diversità genetica complessiva, gli scambi di cervi tra CENTROP e altre due strutture in cattività – il Mari-it Wildlife and Conservation Park e il Negros Forest Park – dovrebbero riprendere. L’ultimo scambio, tra CENTROP e il Negros Forest Park, risale al 2007.
I ricercatori sperano di testare la miscelazione di individui provenienti da popolazioni in cattività e selvatiche per colmare il divario genetico tra le due. Hanno in programma di testare questo presso la Riserva Naturale di Bayawan di 300 ettari (741 acri) a Negros, che ospita 70 cervi.
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Immagine di copertina: Un Visayan spotted deer presso il Centro per gli Studi sulla Conservazione Tropicale dell’Università di Silliman. Immagine di Pippo Carmona per Mongabay.
